Он, находясь в Пури, посчитал, что, находясь в отреченном укладе жизни, не очень хорошо принимать деньги от материалистов, каким был его отец, даже хота он и использовал их в служении Господу Чайтанйе и Его спутникам, устраивая для них пиры. Поэтому он отослал слуг отца обратно. Затем он начал просить милостыню у ворот Симмха-Двара. Люди жертвовали ему какую-то пищу, и он собирал две пригоршни и это являлось пищей для него. Но затем он подумал, что он поступает как проститутка - смотрит на людей, думая при этом "Этот даст мне что- то, а может и этот тоже что-то даст". И он прекратил собирать пожертвования у Симмха-Двара и начал просить какие-то пожертвования у лавочников. Но затем он оставил и это, просто собирая позади храма рис, который выбрасывали коровам. И то, что не ели даже коровы, Рагхунатха Даса собирал, промывал, густо посыпал солью и ел, и это был его прасадам. В последствие Шри Чайтанйа Махапрабху дал ему свою собственную Говардхан-шилу, к которой Он сам прикасался Своим лицом и обнимал, считая его не отличным от самого Господа Шри Кришны. Также он подарил ему небольшую гуньджу. Обычно говорится, что это было ожерелье из ракушек, но в действительности это ожерелье из красных и черных ягод, которые можно найти во Вриндаване и также в Майапуре . Говардхан-шила означал, что он должен жить рядом с холмом Говардхан, в частности на Радха-Кунде, а гуньджа-мала означала, что он должен искать милости Шримати Радхарани. Господь Чайтанйа также дал ему наставления о том, как поклоняться им.

До самого ухода Шри Чайтанйи Махапрабху Рагхунатха Даса оставался в Джаганатха Пури. К этому времени ему было примерно 27-28 лет. Когда Господь Чайтанйа покинул этот мир, для всех вайшнавов наступили трудные времена. Мы можем в какой-то степени понять их умонастроению по тому, что мы сами чувствовали, когда Шрила Прабхупада ушел из этого мира. Однако их трудности не были, подобно нашим, связаны с непониманием как быть сознающими Кришну - они испытывали сильную разлуку со Шри Чайтанйей Махапрабху. Рагхунатха Даса в течение некоторого времени оставался со Сварупой Дамодарой, но через некоторое время Сварупа Дамодара также покинул этот мир. Еще несколько месяцев Рагхунатха Даса оставался с Гададхарой Пандитом, но через год после ухода Господа Чайтанйи Гададхара Пандит тоже ушел, не выдержав разлуки с Ним. Итак, все спутники Господа ушли, и Рагхунатха Даса остался один. Он решил пойти во Вриндаван. И совершить самоубийство, спрыгнув с холма Говардхан. В то время Рупа и Санатана Госвами жили во Вриндаване, и пока Рагхунатха Даса был в пути, к ним во сне пришел Шри Чайтанйа Махапрабху и дал им наставления о том, что Рагхунатха Даса скоро придет к ним во Вриндаван и что они должны заботиться о нем как о младшем брате(они были гораздо старше его, почти на целое поколение), он планирует совершить самоубийство, и вы должны остановить его. Они встретились с ним, сказав: "Таковы наставления Господа Чайтанйи, и ты должен им последовать". Рагхунатха Даса поселился на Радха-Кунде, которую обнаружил Сам Шри Чайтанйа Махапрабху. Он проделал очень большую работу по расширению Радха-Кунды, возрождению мест, связанных с играми Господа Кришны в этих местах, и именно благодаря ему она приняла тот вид, который мы можем видеть сейчас. Он прожил там около 50 лет, практически никуда не уходя оттуда. К тому времени ему исполнилось 75-80 лет.

 Его особым вкладом явилось то, что он написал много важнейших книг, как, например, "Стававали", в которой "Манах-шикша" является одной их важных частей. Хотя мы и называем ее книгой, в ней всего 12 стихов. Также им написана "Вилапта Саманджали" и множество других важных книг. Все они очень важны для рупануг, последователей Шрилы Рупы Госвами, поскольку Рагхунатха Даса Госвами в большей чем остальные Госвами степени показал, как нам, будучи практикующими преданными, следовать наставлениям Шрилы Рупы Госвами. Рупа Госвами дал наставления, в этом его вклад, но Рагхунатха Даса показал, как на практике применять то, что дал нам Рупа Госвами. Им написано также множество замечательных книг, таких как "Дана кели чинтамани", "Мукта чарита" и другие.